Research Software Engineer für Computational Mass Spectrometry

Research Software Engineer für Computational Mass Spectrometry # 80%-100%, Zurich, befristet #### print Drucken  The Functional Genomics Center Zurich (FGCZ) ist eine gemeinsame hochmoderne Forschungs- und Ausbildungseinrichtung der ETH Zurich und der University of Zurich. Mit den neuesten Technologien und Schlüsselkompetenzen für die Omics-Forschung bietet das FGCZ Forschungsdienstleistungen und Projektunterstützung für die Zürcher Life-Science-Forschungsgemeinschaft. Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt oder nach Vereinbarung einen Research Software Engineer am Functional Genomics Center Zurich. Projekt-Hintergrund ## Diese Position konzentriert sich auf massenspektrometrische Daten, mit einem primären Schwerpunkt auf bioinformatischer Analyse und Interpretation zur Unterstützung der Forscher am FGCZ. Innerhalb dieses Feldes deckt das Team die Rohdatenverarbeitung, High-Performance Computing, statistische Auswertung, Interpretation und integrierte Analyse ab. Die Einheit unterhält ein Portfolio von kommerziellen und Open-Source-Anwendungen, die auf unserer Infrastruktur laufen, und etabliert neuartige Datenverarbeitungs- und Analyse-Pipelines.  Ein integraler Bestandteil der Arbeit ist die Integration der Daten in unser Datenmanagementsystem und die Sicherstellung der Reproduzierbarkeit der Analyse. Jobbeschreibung ## • Sie werden die Proteomics- und Metabolomics-User-Community des FGCZ unterstützen, indem Sie bestehende massenspektrometrische Datenverarbeitungs- und Analyse-Pipelines warten und neue entwickeln. • In dieser Rolle werden Sie Ihre Expertise in Informatik und Data Science anwenden, um die Reproduzierbarkeit der durchgeführten Datenanalysen zu gewährleisten. • Als Mitglied der FGCZ-Bioinformatikgruppe werden Sie Back-Office- und User-Desk-Aufgaben übernehmen, um unsere Kooperationspartner an der ETH und der University of Zurich bei der Dateninterpretation und bioinformatischen Projekten zu unterstützen. Profil ## Erforderliche Fähigkeiten und Erfahrungen: • Teamplayer - enge Zusammenarbeit mit Wet-Lab-Wissenschaftlern und Übersetzung ihrer Anforderungen in Analysen • Akademischer Abschluss in einem der relevanten Gebiete, einschließlich (aber nicht beschränkt auf) Informatik, Statistik oder Biologie • Ein Master-Abschluss in einem relevanten Feld; Kandidaten mit einem Ph.D. sind gleichermaßen willkommen • Kenntnisse in den Betriebssystemen Microsoft Windows und Linux, einschließlich Befehlszeilenschnittstellen • Praktische Kenntnisse von mindestens einer Programmiersprache (C++, C\#, Java, Python) und Werkzeugen wie Git • Verantwortungsbewusster und informierter Einsatz von KI-gestützten Werkzeugen in einem wissenschaftlichen Kontext Bevorzugte Fähigkeiten und Erfahrungen: • Vertrautheit mit der Verwaltung und Analyse groß angelegter Datensätze, insbesondere omics-bezogener Daten • Hintergrund in Bioinformatik, idealerweise in der Massenspektrometrie • Erfahrung in Imaging-, Spatial- oder Cross-Omics-Disziplinen • Nachgewiesene Erfolge beim Schreiben und Warten von Code • Erfahrung in R/Bioconductor und clientseitiger Webprogrammierung • Erfahrung mit UI/UX-Design, insbesondere der Entwicklung von webbasierten oder Desktop-Schnittstellen für die wissenschaftliche Datenvisualisierung • Erfahrung mit Virtualisierungstools, z. B. Docker, Apptainer • Erfahrung mit Ressourcenmanagement-Software, z. B. Slurm Die Fähigkeit, selbstständig zu arbeiten, ist eine Voraussetzung, ebenso wie die Fähigkeit, effektiv und teamorientiert mit dem Forschungs- und Technikpersonal des Zentrums sowie externen Forschungsgruppen zu interagieren. Fortgeschrittene Englischkenntnisse sind essenziell, da dies die Arbeitssprache des Zentrums ist. Wir ermutigen insbesondere Bewerbungen von Nachwuchskandidaten, die bestrebt sind, ihre Fähigkeiten in einem anregenden Forschungsumfeld zu entwickeln. Arbeitsplatz ## Arbeitsplatz ## Wir bieten ## A hochinteressante Position an der Schnittstelle zwischen Technologie und Life-Science-Forschung. Die Anstellungsbedingungen entsprechen den Regelungen der ETH Zurich und der University of Zurich. Die Arbeit am FGCZ ermöglicht die Zusammenarbeit mit unserer internationalen, multikulturellen Gruppe in einer motivierenden, freundlichen und flexiblen Atmosphäre. Die Anstellung erfolgt bei der ETH Zurich; die Stelle ist ab sofort verfügbar. chevron\_right Arbeiten, Lehren und Forschen an der ETH Zurich Wir schätzen Vielfalt und Nachhaltigkeit ## Im Einklang mit unseren Werten fördert die ETH Zurich eine inklusive Kultur. Wir fördern die Chancengleichheit, schätzen Vielfalt und pflegen ein Arbeits- und Lernumfeld, in dem die Rechte und die Würde all unserer Mitarbeitenden und Studierenden respektiert werden. Besuchen Sie unsere Website für Chancengleichheit und Vielfalt, um zu erfahren, wie wir ein faires und offenes Umfeld gewährleisten, in dem jeder wachsen und gedeihen kann. Nachhaltigkeit ist ein Kernwert für uns - wir arbeiten kontinuierlich an einer klimaneutralen Zukunft. Neugierig? Wir auch. ## Wir freuen uns auf Ihre Online-Bewerbung mit folgenden Unterlagen: • Lebenslauf • Motivationsschreiben • Diplome und Arbeitszeugnisse • Referenzschreiben (im Falle früherer Anstellungen) Weitere Informationen über FGCZ finden Sie auf unserer Website. Fragen zur Position sollten an Christian Panse, cp@fgcz.ethz.ch (keine Bewerbungen) gerichtet werden. Bitte beachten Sie, dass wir ausschließlich Bewerbungen akzeptieren, die über unser Online-Bewerbungsportal eingereicht werden. Bewerbungen per E-Mail oder Post werden nicht berücksichtigt. Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung bis zum 30. August 2026 ein. Über ETH Zürich ## Die ETH Zurich ist eine der weltweit führenden Universitäten mit Spezialisierung auf Wissenschaft und Technologie. Wir sind bekannt für unsere exzellente Ausbildung, wegweisende Grundlagenforschung und den direkten Transfer von neuem Wissen in die Gesellschaft. Über 30.000 Menschen aus mehr als