Research Software Engineer für computergestützte Massenspektrometrie

Das Functional Genomics Center Zurich (FGCZ) ist eine gemeinsame, hochmoderne Forschungs- und Ausbildungseinrichtung der ETH Zurich und der University of Zurich. Mit den neuesten Technologien und Schlüsselkompetenzen für die Omics-Forschung bietet das FGCZ Forschungsdienstleistungen und Projektunterstützung für die Zürcher Life-Science-Forschungsgemeinschaft. Wir suchen zum nächstmöglichen Zeitpunkt oder nach Vereinbarung einen Research Software Engineer am Functional Genomics Center Zurich. Projektgrundlage Diese Position konzentriert sich auf massenspektrometrische Daten, mit einem primären Schwerpunkt auf bioinformatischer Analyse und Interpretation zur Unterstützung der Forschenden am FGCZ. Innerhalb dieses Bereichs deckt das Team die Rohdatenverarbeitung, High-Performance Computing, statistische Auswertung, Interpretation und integrierte Analyse ab. Die Einheit unterhält ein Portfolio von kommerziellen und Open-Source-Anwendungen, die auf unserer Infrastruktur laufen, und etabliert neuartige Datenverarbeitungs- und Analyse-Pipelines. Ein integraler Bestandteil der Arbeit ist die Integration der Daten in unser Datenmanagementsystem und die Gewährleistung der Reproduzierbarkeit der Analyse. Jobbeschreibung • Sie unterstützen die Proteomics- und Metabolomics-User-Community des FGCZ durch die Wartung bestehender und die Entwicklung neuer massenspektrometrischer Datenverarbeitungs- und Analyse-Pipelines • In dieser Rolle wenden Sie Ihre Expertise in Informatik und Data Science an, um die Reproduzierbarkeit der durchgeführten Datenanalyse sicherzustellen • Als Mitglied der FGCZ-Bioinformatikgruppe werden Sie Back-Office- und User-Desk-Aufgaben übernehmen, um unsere Kooperationspartner an der ETH und der University of Zurich bei der Dateninterpretation und bioinformatischen Projekten zu unterstützen Profil Erforderliche Fähigkeiten und Erfahrungen: • Teamplayer - enge Zusammenarbeit mit Wet-Lab-Wissenschaftlern und Übersetzung ihrer Anforderungen in Analysen • Akademischer Abschluss in einem der relevanten Gebiete, einschließlich (aber nicht beschränkt auf) Informatik, Statistik oder Biologie • Ein Master-Abschluss in einem relevanten Bereich; Bewerber mit einem Ph.D. sind gleichermaßen willkommen • Kenntnisse in Microsoft Windows und Linux-Betriebssystemen, einschließlich Kommandozeilenschnittstellen • Praktische Kenntnisse in mindestens einer Programmiersprache (C++, C#, Java, Python) und Tools wie Git • Verantwortungsbewusster und informierter Umgang mit KI-gestützten Tools in einem wissenschaftlichen Kontext Bevorzugte Fähigkeiten und Erfahrungen: • Vertrautheit mit der Verwaltung und Analyse großer Datensätze, insbesondere omics-bezogener Daten • Hintergrund in Bioinformatik, idealerweise in der Massenspektrometrie • Erfahrung in Imaging-, Spatial- oder Cross-Omics-Disziplinen • Nachgewiesene Erfahrung im Schreiben und Warten von Code • Erfahrung in R/Bioconductor und clientseitiger Webprogrammierung • Erfahrung mit UI/UX-Design, insbesondere der Entwicklung von webbasierten oder Desktop-Schnittstellen für die wissenschaftliche Datenvisualisierung • Erfahrung mit Virtualisierungstools, z. B. Docker, Apptainer • Erfahrung mit Ressourcenmanagement-Software, z. B. Slurm Die Fähigkeit, selbstständig zu arbeiten, ist eine Voraussetzung, ebenso wie die Fähigkeit, effektiv und teamorientiert mit dem Forschungs- und Technikpersonal des Zentrums sowie externen Forschungsgruppen zu interagieren. Fortgeschrittene Englischkenntnisse sind essenziell, da dies die Arbeitssprache des Zentrums ist. Wir ermutigen insbesondere Bewerbungen von Nachwuchskandidaten, die bestrebt sind, ihre Fähigkeiten in einem anregenden Forschungsumfeld zu entwickeln. Wir bieten Eine hochinteressante Position an der Schnittstelle zwischen Technologie und Life-Science-Forschung. Die Anstellungsbedingungen richten sich nach den Vorschriften der ETH Zurich und der University of Zurich. Die Arbeit am FGCZ ermöglicht die Zusammenarbeit mit unserer internationalen, multikulturellen Gruppe in einer motivierenden, freundlichen und flexiblen Atmosphäre. Die Anstellung erfolgt bei der ETH Zurich; die Stelle ist ab sofort verfügbar. Wir schätzen Vielfalt und Nachhaltigkeit Im Einklang mit unseren Werten fördert die ETH Zurich eine inklusive Kultur. Wir fördern die Chancengleichheit, schätzen Vielfalt und pflegen ein Arbeits- und Lernumfeld, in dem die Rechte und die Würde all unserer Mitarbeitenden und Studierenden respektiert werden. Besuchen Sie unsere Website zu Gleichstellung und Vielfalt, um zu erfahren, wie wir ein faires und offenes Umfeld gewährleisten, in dem sich jeder entwickeln und entfalten kann. Nachhaltigkeit ist ein Kernwert für uns – wir arbeiten kontinuierlich an einer klimaneutralen Zukunft. Neugierig? Wir auch. Wir freuen uns auf Ihre Online-Bewerbung mit folgenden Unterlagen: • CV • Motivationsschreiben • Diplome und Arbeitszeugnisse • Referenzschreiben (im Falle früherer Anstellungen) Weitere Informationen über das FGCZ finden Sie auf unserer Website. Fragen zur Position sollten an Christian Panse, cp@fgcz.ethz.ch (keine Bewerbungen) gerichtet werden. Bitte beachten Sie, dass wir ausschließlich Bewerbungen akzeptieren, die über unser Online-Bewerbungsportal eingereicht werden. Bewerbungen per E-Mail oder Post werden nicht berücksichtigt. Bitte reichen Sie Ihre Bewerbung bis zum 30. August 2026 ein.